Порівняльна гібридизація геномів


Free Web Hosting with Website Builder

Порівняльна гібридизація геномів або гібридизація геномів (англ. Comparative genomic hybridization, CGH або genomic hybridization) — метод молекулярної генетики для порівняння геномів генетично близьких клітин. Метод звичайно використовується у систематиці для порівняння пов'язаних груп організмів (звичайно підвидів і видів прокаріотів) та для для аналізу зміни чила копій генів в ДНК пухлинних клітин. Метод заснований на гібридизації флюоресцентно або радіоактивно помічених ДНК пухлини (або одного організму) і нормальної ДНК (або іншого організму).

У систематиці

У систематиці звичайно використовуються ДНК помічені за допомогою радіоактичного ізотопу або одного барвника. Генмна ДНК розрізається на відносно короткі частини, ДНК одного організму помічається і додається в значно меншій концентрації. Після нагрівання і охолодження одно-ланцюжкова ДНК відділяється та вимірюється кількість поміченої дво-ланцюжкової ДНК. Це число вказує на кількість ідентичних фрагментів ДНК. Якщо кілкість ідентичних генів більше ~ 70 %, прокаріотичні штами ймовірно слід віднесто до одного виду, якщо більше ~ 25 % — до одного роду. Оскільки випадкові помилки метода зараз складають близько 10 %, для таксонів більш високого рангу метод не використовується.

У генетиці раку

Для порівняння числа генів між нормальними і пухлинними клітинами звичайно використовуються два барвникі, наприклад, такі пари барвників як флюоресцеїн (FITC) — родамін. Використовуючи епіфлюоресцентну мікроскопію і кількісний аналіз зображення, виявляються регіональні відмінності в співвідношенні свічення пухлини порівняно з контрольною ДНК, і використовується для ідентифікації анормальних регіонів в геномі клітин пухлини. CGH виявить тільки неврівноважені хромосомні зміни. Структурна аберація хромосом, наприклад, збалансовані взаємні переміщення та інверсії, не можуть бути виявлені.


Метелик Це незавершена стаття з біології.
Ви можете допомогти проекту, виправивши або дописавши її.

Посилання

  • Madigan, Michael and Martinko, John. Brock Biology of Microorganisms. 11th ed. Prentice Hall, 2005. ISBN 0-1314-4329-1. Використання метода і систематиці.
  • Progenetix database: Колекція даних CGH із публікацій (> 13000 випадків, 2006).
  • CGHtracker: Спроба приведення CGH публікацій з орігінальними даними. Частина проекту Progenetix.
  • NCBI's Cancer Chromosomes: Cancer Chromosome, частина системи NCBI Entrez, містить кілька баз даних заснованих на даних CGH.






Why are we here?
All text is available under the terms of the GNU Free Documentation License
This page is cache of Wikipedia. History